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物理学院的实体单位和以物理学院为依托的研究单位及其相应的学科如下图示。物理学院目前按物理学类和天文学科招生。同学入学后，第一、二年级不分专业，根据自己的兴趣，在选课指导委员会指导和综合指导下，自主选修数学、物理、计算机、电子技术等基础课程，三年级起，学院坚持“以人为本”的理念，在充分尊重学生自主选择的基础上，以物理学类入校的同学们在物理学科、大气与海洋学科中选课、研修，以天文学科入校的同学在天体物理专业内各方向分别选课、研修。