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安徽工程大学自1977年开始招收“工业电气自动化”专业四年制本科生，1998年更名为“自动化”专业。自动化专业2008年被列为国家级“第一类特色专业建设点”，2011年被批准为安徽省实施“卓越工程师教育培养计划”专业，2013年获批国家级本科专业综合改革试点建设项目，2013年获批国家级大学生校外实践教育基地，2018年获批安徽省级一流（品牌）专业建设项目，2019年6月将迎接中国工程教育专业认证专家组进校考察。
目前，本专业每年招生规模约160人，在校生共683人。本专业具有吸引优秀生源的制度和措施，招生生源充足，2012年进入一本招生，历年招生分数线在全校名列前茅，生源质量优秀。本专业现有专任教师32人，其中教授10人，副教授/高级实验师14人，博士学位教师13人；全国优秀教师1人，省级教学名师1人；外聘企业专家11人。以本专业为主体的“检测技术与自动化装置”学科1997年即被列为安徽省重点学科，2014年“控制科学与工程”学科被列为安徽省学科重大建设项目，具有“控制科学与工程”一级学科硕士学位授权点，与江南大学联合培养博士研究生。建设有“电气传动与控制”和“检测技术与节能装置”两个安徽省重点实验室，2011年牵头建设省级“皖江高端装备制造协同创新中心”，2019年立项建设“高端装备先进感知与智能控制”教育部重点实验室。在全国第四轮学科评估中，“控制科学与工程”学科获得了C+评级，位列全国同类学科高校前40%～50%。