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培养目标：本专业旨在培养具有物流系统工程及管理基础知识，了解物流实务运作与管理相关业务，关注物流行业发展前沿问题，具有创新能力和团队精神的高级物流工程与管理人才。
专业特色：本专业前身为成立于1989年的航管系综合运输专业，是国内最早设立的培养港航物流工程技术与管理人才的两个专业之一，体现了大连海事大学的传统优势，是学校“双一流”建设的主干专业、也是学校重点建设的航运特色品牌专业方向之一。本专业在我国航运、港口、货运代理及仓储等国际物流行业，以及与之相关的运输服务与金融企业、大专院校和科研院所中均有重要的影响。
物流工程专业师资队伍年龄职称结构合理、学术水平一流、教学经验丰富，拥有博士学位的比例为90%，还拥有完备的实验教学仪器设备。2006年被确定为学校重点建设的专业之一；2010年获“辽宁省示范专业”；2014年，本专业在辽宁省本科专业评价中名列第一，同时获“辽宁省本科综合改革试点专业”；2015年，本专业获“辽宁省本科优势特色专业”；2018年，获“辽宁省普通高等学校首批一流本科教育示范专业”。
主要课程：管理运筹学、系统工程、机械设计基础、交通工程学、物流系统仿真、物流中心规划设计、工程物流、项目管理、交通运输规划理论与方法、港口装卸工艺、高级英语技能、国际商务英语、物流方案设计、物流信息系统、运输代理业务、租船运输业务、航运管理、海商法概论等。